V letech 2013 až 2024 působil na odboru územního plánování Ministerstva pro místní rozvoj, a to na různých pozicích, včetně pozice ředitele tohoto odboru (2016-2024). Zde se podílel na přípravě nového stavebního zákona v části týkající se územního plánování, dále se spolupodílí na přípravě novel stavebního zákona i jeho prováděcích předpisů.
Ing. Roman Vodný, Ph.D. se dále věnuje přípravě úředníků stavebních úřadů na zvláštní část zkoušky odborné způsobilosti na úseku územního plánování, kde dlouhodobě působí též jako zkušební komisař. Místopředseda autorizační rady České komory architektů.